|
FISH анализ в офтальмологии Fluorescence in situ hybridization
В последнее время используется методика т. н. спектрального кариотипирования (флюоресцентная гибридизация in situ, Fluorescence in situ hybridization, FISH), состоящая в окрашивании хромосом набором флуоресцентных красителей, связывающихся со специфическими областями хромосом. В результате такого окрашивания гомологичные пары хромосом приобретают идентичные спектральные характеристики, что не только существенно облегчает выявление таких пар, но и облегчает обнаружение межхромосомных транслокаций, то есть перемещений участков между хромосомами — транслоцированные участки имеют спектр, отличающийся от спектра остальной хромосомы.
FISH анализ помогает в случае гаплонедостаточности, когда мутации или делеции в одном из аллелей порождает потерю функции пострадавшего участка, которые не полностью компенсируется за счет другого аллеля. Одним из примеров такого заболевания является синдром Williams-Beuren. Там, где ожидается удвоение, наблюдают флуоресценцию трех участков: два от нормальных аллелей и один от поврежденного. Применяют положительный контроль, в идеале другого цвета и расположенный на другом участке этой же хромосомы. В общей сложности 20 клеток должны показать одинаковый результат, чтобы поставить диагноз. Вот некоторые примеры:
- микроделеция 26 генов в участке 7q11.23 при синдроме Williams-Beuren,
- синдром Прадера-Вилли,
- синдром Angelman, которые имеют делецию участков del(15)( q11.2q11.2).
- WAGR синдром (опухоль Вильмса, аниридия, пороки развития мочеполового тракта и отсталость) при делеции 11p13.
Стандартный флуоресцентный микроскоп позволяет визуализировать только три цвета, однако метод окраски и захвата изображений помощью компьютерной системы позволяют применить различные цвета для всех 24 типов различных хромосом.
Типы генетической диагностики в офтальмологии:
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Кариотипирование |
флюоресцентная гибридизация in situ, Fluorescence in situ hybridization |
Спектральный кариотип spectral karyotype |
SSDGE в генетике - single-strand DNA gel electrophoresis (электрофорез в геле одноцепочечной ДНК) |
DGGE - denaturing gradient gel electrophoresis денатурирующего градиентного гель-электрофореза |
анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов Restriction Fragment Length Polymorphism |
Специфичный микрочип |
Типичный микрочип |
Прямое секвенирование |
|
|