|
Генетическая ДНК диагностика пигментного ретинита (= дистрофия сетчатки = тапеторетинальная абиотрофии сетчатки ). Гены CA4, FSCN2, IMPDH1, NRL, PRPF3, PRPF31, PRPF8, RDS, RHO, ROM1, RP1, RP9, CRX
АД тест на 414 мутаций в 16 генах CA4, FSCN2, IMPDH1, NRL, PRPF3, PRPF31, PRPF8, RDS, RHO, ROM1, RP1, RP9, CRX, TOPORS, KLHL7 и PNR
АР тест на 594 мутации в генах CERKL, CNGA1, CNGB1, MERTK, PDE6A, PDE6B, PNR, RDH12, RGR, RLBP1, SAG, TULP1, CRB, RPE65, USH2A, USH3A, LRAT, PROML1 и PBP3, а также полностью кодирующий участок гена RPE65
X-сцепленный Тест на 184 мутации в генах RP2 и RPGR (кроме ORF15)
Для понимания патологических метаболических процессов, приводящих к пигментному ретиниту (пигментной абиотрофии сетчатки), необходимо знать геномный контроль фототрансдукции (светопередачи).
Описание заболевания
Частота встречаемости заболевания в популяции 1:5 000. Приблизительно 50000 человек в России, 100000 человек в СНГ, 1,5 млн человек во всем мире страдают пигментным ретинитом.
Вопрос с сайта: Здравствуйте. Мне 40 лет, диагноз: пигментная дегенерация сетчатки. Меня интересует следующее: если приехать к Вам на диагностику и наперед забегая, т.е. Вы обнаружите ген, который поврежден в "моих глазах", как мне поступать дальше в плане лечения, если Вы, я так понимаю не занимаетесь генотеропией?
Я хочу получить от Вас совет как правильно поступить мне в определении мутации какого-то гена. Как мне узнать анализ каких генов нужен в моем случае? Стоит ли ради этого ехать к Вам издалека или, как Вы писали, можно только отправить Вам кровь для анализа или диагностики?
Ответ: Здравствуйте, Петр! (Имя изменено)
Пигментная дегенерация сетчатки - многофакторное заболевание, много различных изменений в геноме приводят к нему. Поэтому данная ситуация - детективное расследование с учетом тех данных, которыми мы располагаем.
1. нужна наиболее подробная клиническая картина Вашего заболевания. Самый минимум, нужный мне для анализа, приведен здесь: http://oftalmic.ru/anamnesis. php
2. для определения типа наследования нужна подробная карта встречаемости заболевания в Вашей семье. О том, как составлять генеалогическое древо, здесь: http://oftalmic.ru/genealogy. php (о типах наследования здесь: http://oftalmic.ru/ inheritance.php ). Будет лучше, если данную карту Вам поможет составить специалист (например, клинический генетик). Читать далее >>
|
|
Моногенетические ретинальные и витреоретинальные заболевания отличаются большой гетерогенностью и разнообразием клинических проявлений. На сегодняшний день известно по меньшей мере 180 различных генов, мутации в которых ассоциированы с приблизительно 20 ретинальными и витреоретинальными патологиями (обзор
Berger W, Kloeckener-Gruissem B, Neidhardt J, 2010: The molecular basis of human retinal and vitreoretinal diseases. Prog Retin Eye Res 29:335-375). Так как приходится секвенировать большое количество генов, необходима тщательная подборка и подсчет количества необходимых для проверки генов в конкретном случае заболевания. На рисунке представлен пример генетической разнородности и клинической вариабельности.
Классификация моногенных палочковых дистрофий сетчатки, которые могут быть стационарными (ночная слепота) или прогрессирующими (пигментный ретинит). При синдромах глазные проявления связаны с другими клиническими проявлениями, например, глухотой при синдроме Ашера. Количество генов, известных к августу 2011 года, представлены при доминантных, рецессивных и Х-сцепленных формах заболеваний.
Вариабельность клинических симптомов при моногенных заболеваниях сетчатки. Клинические проявления мутаций в каждом из генов могут быть очень разными. Круги обозначают различные клинические диагнозы, Названия генов в пересекающихся кругах обозначают, что мутации могут приводить к обоим видам фенотипа.
Исследовательской группой из Цюриха (Швейцария) и Тюбингена (Германия) разработан специальный комбинированный тест retNGS ((retinal next generation sequencing - секвенирование нового поколения генов сетчатки), исследование включает в себя секвенирование всех белок-кодирующих последовательностей известных на сегодняшний день всех 168 генов дистрофий сетчатки и последующий анализ на платформе (SOLiD 4).
Краткая статья о генетической диагностике дистрофий сетчатки >>
Пигментный ретинит диагностируют у одного из 5000 людей.
Ген |
Локус |
Белок |
Тип заболевания |
Тип наследования |
OMIM |
RP1 (ORP1) |
8q11-q13 |
регулируемый кислородом белок фоторецептора-1 |
RP1 |
АД, АР |
180100 |
RP2 |
Xp11.3 |
RP2 |
RP2 |
Х-сцепленный рецессивный |
312600 |
RPGR |
Xp21.1 |
регулятор ГТФазы |
RP3 (RP15) |
Х-сцепленный |
300029 |
RHO |
3q21-q24 |
родопсин |
RP4 |
АД, АР |
180380 |
PRPH2 |
6p21.1-cen |
периферин-2 |
RP7 |
АД |
608133 |
RP9 |
7p14.2 |
RP9 |
RP9 |
АД |
180104 |
IMPDH1 |
7q31.1-q32 |
дегидрогеназа инозин-5-прим-монофосфатазы |
RP10 |
АД |
180105 |
PRPF31 |
19q13.4 |
предшественник 31-го фактора процессинга мРНК |
RP11 |
АД |
600138 |
CRB1 |
1q31-q32.1 |
гомолог-1 белка "crumbs" дрозофилы |
RP12 |
АР |
600105 |
PRPF8 |
17p13.3 |
предшественник 8-го фактора процессинга мРНК |
RP13 |
АД |
600059 |
TULP1 |
6p21.3 |
TUB-подобный белок 1 |
RP14 |
АР |
600132 |
CA4 |
17q23 |
карбоангидраза 4 |
RP17 |
АД |
600852 |
PRPF3 |
1q21.2 |
предшественник 3-го фактора процессинга мРНК |
RP18 |
АД |
601414 |
ABCA4 |
1p21-p13 |
АТФ-связывающий белок |
RP19 |
АД, АР |
601718 |
RPE65 |
1p31 |
специфичный белок пигментного эпителия сетчатки массой 65 кД |
RP20 |
АР |
180069 |
EYS |
6q12 |
гомолог YES-белка дрозофилы |
RP25 |
АР |
602772 |
CERKL |
2q31.2-q32.3 |
церамид-киназа-подобный белок |
RP26 |
АР |
608380 |
NRL |
14q11.1-q11.2 |
белок нейросетчатки с лейциновой "молнией" |
RP27 |
АД |
162080 |
FSCN2 |
17q25 |
фасцин |
RP30 |
АД |
607921 |
TOPORS |
9p21 |
связывающий топоизомеразу-I белок, богатый аргинином/серином |
RP31 |
АД |
609923 |
SEMA4A |
1q22 |
семафорин 4А |
RP35 |
АД, АР |
610282 |
PRCD |
17q22 |
гомолог PRCD |
RP36 |
АР |
610599 |
NR2E3 |
15q23 |
белок ядерного рецептора |
RP37 |
АД, АР |
611131 |
MERTK |
2q14.1 |
тирозинкиназа |
RP38 |
АР |
604705 |
USH2 |
1q41 |
ушерин |
RP39 |
АР |
608400 |
PDE6B |
4p16.3 |
фосфодиэстераза 6В |
RP40 |
АР |
180072 |
PROM1 |
4p15.3 |
проминин 1 |
RP41 |
АР |
612095 |
KLHL7 |
7p15.3 |
KELCH-подобный белок 7 |
RP42 |
АД |
612943 |
CNGA1 |
4p12cen |
альфа-субъединица белка катионного канала |
RP42 |
АР |
123825 |
PDE6A |
5q31.2-q34 |
фосфодиэстераза 6A |
RP43 |
АР |
180071 |
RGR |
10q23 |
парный рецептор G-белка сетчатки |
RP44 |
АД, АР |
600342 |
CNGB1 |
16q13 |
бета-субъединица белка катионного канала |
RP45 |
АР |
600724 |
IDH3B |
20p13 |
бета-субъединица изоцитрат-дегидрогеназы |
RP46 |
АР |
612572 |
SAG |
2q37.1 |
аррестин |
RP47 |
АР |
181031 |
GUCA1B |
6p21.1 |
активатор гуанилатциклазы 1В |
RP48 |
АД |
602275 |
CNGA1 |
4p12cen |
альфа-субъединица белка катионного канала |
RP49 |
АР |
123825 |
BEST1 |
11Q13 |
анионный канал |
PR50 |
АД |
613194 |
LRAT |
41q32.1 |
лецитин ретинол ацилтрансфераза |
- |
АР |
604863 |
|
Гены пигментного ретинита, описанные в таблице выше |
ABCA4 |
|
ABCA4 |
BEST1 |
|
BEST1 |
C2orf71 |
|
|
CA4 |
|
CA4 |
CERKL |
|
CERKL |
CNGA1 |
|
CNGA1 |
CNGB1 |
|
CNGB1 |
CRB1 |
|
CRB1 |
CRX |
|
|
EYS |
|
EYS |
FAM161A |
|
|
FSCN2 |
|
FSCN2 |
GUCA1B |
|
GUCA1B |
IDH3B |
|
IDH3B |
IMPDH1 |
|
IMPDH1 |
IMPG2 |
|
|
KLHL7 |
|
KLHL7 |
LRAT |
|
LRAT |
MERTK |
|
MERTK |
MT-TS2 |
|
|
NR2E3 |
|
NR2E3 |
NRL |
|
NRL |
PDE6A |
|
PDE6A |
PDE6B |
|
PDE6B |
PDE6G |
|
|
PRCD |
|
PRCD |
PROM1 |
|
PROM1 |
PRPF3 |
|
PRPF3 |
PRPF31 |
|
PRPF31 |
PRPF8 |
|
PRPF8 |
PRPH2 |
|
PRPH2 |
RBP3 |
|
|
RDH12 |
|
|
RGR |
|
RGR |
RHO |
|
RHO |
RLBP1 |
|
|
ROM1 |
|
|
RP1 |
|
RP1 (ORP1) |
RP2 |
|
RP2 |
RP9 |
|
RP9 |
RPE65 |
|
RPE65 |
RPGR |
|
RPGR |
SAG |
|
SAG |
SEMA4A |
|
SEMA4A |
SNRNP200 |
|
|
SPATA7 |
|
|
TOPORS |
|
TOPORS |
TTC8 |
|
|
TULP1 |
|
TULP1 |
USH2A |
|
USH2 |
ZNF513 |
|
USH2A |
|
|
ZNF513 |
(с) Марианна Иванова, июнь 2012
|
|