Офтальмик в linked in Офтальмик в твиттере Офтальмик вконтакте Статистика сайта Офтальмик.ру
Генетическая диагностика глазных болезней
.:: Новости ::: О компании ::: Услуги ::: Цены ::: Гены ::: Пациентам ::: Лечение ::: FAQ ::: Контакты ::. 
 
Диагностируем:
· Катаракта
· Глаукома
· Макулярная дегенерация
· Близорукость
· Пигментный ретинит
· Дистрофии сетчатки
· Дистрофии роговицы
· Увеиты
· Ретинобластома
· Амавроз Лебера
· Микрофтальм
· Анофтальм
· Аксенфельда-Ригера
· Ваарденбурга синдром
· Ретиношизис
· Косоглазие
· Выезд окулиста на дом
· Синдром Ашера
· Редкие болезни
 
 
Обучение
· Конференции
· Книги по офтальмогенетике
· Книга О.В. Хлебниковой Наследственная патология органа зрения
· Методы исследования в офтальмологии
· Классификация наследственных болезней сетчатки
· Критерии клинической классификации
· Форум по молекулярной медицине 2013
· Анализ геномных NGS данных
 
 
Пороки развития
· размеров и формы глаза
· придаточного аппарата
· роговицы
· сосудистой оболочки глаза
· хрусталика
· сетчатки
· зрительного нерва
· МУТАНТНЫЕ БЕЛКИ
 
 
Типы диагностики
· CLIA - что это?
· Кариотипирование
· FISH анализ
· SKY тест
· SSDGE или SSCP
· DGGE
· RFLPs
· Специфичный микрочип
· Типичный микрочип
· Прямое секвенирование
 
 
Панели тестов
· Панель "цилиопатии"
· Панель "пигментный ретинит"
· Панель "все глазные заболевания"
· Животные модели
· Пигментный ретинит: новости 2013
· Метаболизм сетчатки
· Дегенерация сетчатки и клеточная биология
 
 

Генетическая диагностика глаукомы в России

данная статья в pdf (510 кб)

Методические рекомендации для врачей

Автор: Марианна Иванова ,
врач-офтальмолог, к.м.н.,
основатель проекта www.oftalmic.ru

Глаукома – это атрофия зрительного нерва и сужение полей зрения при повышенных или нормальных цифрах внутриглазного давления (ВГД). В России около 1 миллиона человек страдает глаукомой, в мире насчитывается 67 миллионов людей с диагнозом глаукома (Gibson J. 2012). Глаукома – весьма разнородное по этиологии заболевание, причинами которого могут быть: травма глаза, особое строение глаза (при закрытоугольной глаукоме), катаракта (когда мутный набухающий хрусталик затрудняет пути оттока внутриглазной жидкости – ВГЖ), генетические нарушения, приводящие к синтезу патологических белков, затрудняющих отток жидкости из глаза, гипоксические процессы в глазу и множество других факторов. Результат прогрессирования глаукомы – это необратимая атрофия волокон зрительного нерва либо вследствие затрудненного оттока ВГЖ из глаза и повышения давления в глазу, либо вследствие действия других факторов, приводящих к атрофии без выраженного повышения ВГД.

В России множество исследователей и практикующих врачей направляют свои усилия на поиск эффективных способов лечения и предотвращения развития глаукомы. На сегодняшний день при анализе генома человека найдены несколько десятков участков (локусов) ДНК, изменения в которых вызывают глаукому (табл. 1).

Таблица 1. Гены, ассоциированные с развитием ПОУГ (Fuse N ., 2010)

Символ гена

Название гена

MIM #

Расположение гена

Ссылка

AGTR2

Angiotensin II receptor, type 2

300034

Xq22-q23

(Hashiz ume et al . 2005)

ANP

Atrial natriuretic peptide

108780

1p36.2

(Tunny et al . 1996)

APOE

Apolipoprotein E

107741

19q13.2

(Copin et al . 2002)

CDKN1A

Cyclin-dependent kinase inhibitor 1A

116899

6p21.2

(Tsai et al . 2004)

CDH-1

E-cadherin

192090

16q22.1

(Lin et al . 2006)

CYP1B1

Cytochrome P450, subfamily I, polypeptide 1

601771

2p22-p21

(Vincent et al . 2002)

EDNRA

Endothelin receptor, type A

131243

4q31.2

(Ishikawa et al . 2005)

GPDS1

Glaucoma-related pigment dispersion syndrome

600510

7q35-q36

(Nakamura et al . 2009)

GSTM1

Glutathione S-transferase, mu-1

138350

1p13.3

(Juronen et al . 2000)

HSPA1A

Heat-shock 70kD protein 1A

140550

6p21.3

(Tosaka et al . 2007)

IGF2

Insulin-like growth factor II

147470

11p15.5

(Tsai et al . 2003)

IL1 ?

Interleukin 1-beta

147720

2q14

(Lin et al . 2003)

MFN1

Mitofusin 1

608506

3q25-q26

(Wolf et al . 2009)

MFN2

Mitofusin 2

608507

1p36.2

(Wolf et al . 2009)

MTHFR

5,10-methylenetetrahydrofolate reductase

607093

1p36.3

(Junemann et al . 2005)

NCK2

NCK adaptor protein 2

604930

2q12

(Akiyama et al . 2008)

NOS3

Nitric oxide synthase 3

163729

7q36

(Tunny et al . 1998)

NTF4

Neurotrophin 4

162662

19q13.3

(Pasutto et al . 2009)

OCLM

Oculomedin

604301

1q31.1

(Fujiwara et al . 2003)

OLFM2

noelin 2

ID: 93145

19p13.2

(Funayama et al . 2006)

OPA1

Optic atrophy 1

605290

3q28-q29

(Aung et al . 2002)

PARL

presenilin associated, rhomboid-like

607858

3q27

(Wolf et al . 2009)

PON1

Paraoxonase 1

168820

7q21.3

(Inagaki et al . 2006)

TAP1

Transporter, ATP-binding cassette, major histocompatibility complex, 1

170260

6p21.3

(Lin et al . 2004)

TLR4

Toll-like receptor 4

603030

9q32-q33

(Shibuya et al . 2008)

TNF

Tumor necrosis factor

191160

6p21.3

(Lin et al . 2003a)

TP53

Tumor protein p53

191170

17p13.1

(Lin et al . 2002)

Механизмы, по которым развивается болезнь при найденных мутациях, во многих случаях неясен. Однако есть несколько генов, для которых лучше, чем для остальных изучены причинно-следственные взаимосвязи при патогенезе глаукомы. Это гены миоцилина ( MYOC ), оптиневрина (OPTN), цитохрома P450 первого семейства подсемейства B полипептид 1 (CYP1B1), WD повторяющегося домена 36 (WDR36) и нейротрофина 4 (NTF4). О первых трех из них и пойдет речь в данной статье.

Ген MYOC (миоцилин)

1. Характеристика гена миоцилина

Ген миоцилина расположен на длинном плече 1-ой хромосомы (локус 1q24.3-q25.2), был впервые описан Stone в 1997 году, имеет размер 17217 пар нуклеотидов (обозначают обычно в тысячах пар нуклеотидов, называя их килобазами), то есть 17,22 кб, состоит из промотерной (начальной) части, трех экзонов: N -концевой миозин-подобный домен, С-концевой ольфактомедин-подобный домен и средний домен - связка, а также двух длинных интронных областей. С гена миоцилина считывается полипептид длиной 504 аминокислоты. Подавляющее большинство мутаций в гене, вызывающих развитие глаукомы, находятся в третьем длинном ольфактомедин-подобном экзоне. В норме ген экспрессируется главным образом в сетчатке.

Рис. 1. Ген миоцилина, myocilin ( MYOC )

2. Функция белка, синтезируемого с гена MYOC в норме и при мутациях

Миоцилин – гидрофобный белок, который был найден практически во всех тканях организма (цилиарное тело, сфинктер зрачка, сетчатка, склелетные мышцы, сердце и др.), В норме белок существует в виде гомодимера, взаимодействует с ольфактомедином (ноэлин-3), считывающимся с гена OLFM 3. В клетке располагается в области шероховатого эндоплазматического ретикулума в большом количестве в клетках фоторецепторов. Основное количество белка в норме обнаружено в области трабекулярного аппарата глаза, передней и увеальной его части. При глаукоме белок миоцилин обнаруживают в значительно увеличенных количествах, причем во всех частях трабекулярного аппарата, не зависимо от степени выраженности клинических проявлений глаукомы. Для миоцилина характерна посттрансляционная модификация, «созревание» белка после его синтеза путем присоединения остатков углеводов (гликозилирование) или пальмитиновой кислоты (пальмитилирование).

белок миоцилин строение белка миоцилина

Рис. 2. Желтым показан миозин-подобный участок белка миоцилина «лейциновые молнии», голубым показан ольфактомедин-подобный участок миоцилина (один из них с красной полосой мутирован) и красный соединительный фрагмент между этими участками.

схема функций белка миоцилина в клетке

Регуляция цитоскелета и клеточная миграция

Рис. 3. Схематическая диаграмма роли миоцилина в клетке.

Миоцилин является модулятором Wnt сигнального пути (от рецепторов на поверхности клетки до экспрессии ДНК в ядре), который отвечает за межклеточные взаимодействия в эмбриогенезе и во взрослом организме. Миоцилин может связываться с Wnt антагонистами WIF-1 и sFRPs и конкурировать с Wnt за связывание с некоторыми Fzd рецепторами. Белки, на которые действует миоцилин, на рисунке 3 показаны красным. Тонкие непрерывные линии с двумя стрелками показывают белки, которые взаимодействуют друг с другом. Подробнее об этом в публикациях Kwon HS 2009, 2011. Таким образом, важно понимать, что миоцилин участвует

  • в реорганизации актинового цитоскелета клетки
  • в миграции клеток
  • в межклеточных взаимодействиях.

На сегодняшний день в pubmed.com около 500 публикаций, описывающих свойства и функции миоцилина.

3. Какую роль играет миоцилин в развитии глаукомы

До сих пор ясного понимания роли миоцилина в патогенезе глаукомы нет. Предполагалось, что при мутациях, изменяющих заряд на поверхности белка или 3 D -структуру белка, у миоцилина появляется тенденция к формированию конгломератов, состоящих из десятков и сотен молекул, которые, попадая в трабекулярную сеть, своим размером засоряют ее и затрудняют отток внутриглазной жидкости, однако гистологически данная гипотеза не была подтверждена. Поэтому сейчас преобладает теория, по которой мутантный миоцилин образует не гомодимеры, а гетеродимеры, например, с кальпаином II , что приводит к накоплению в эндоплазматическом ретикулуме и секреции в экстраклеточный матрикс мутантных гетероолигомеров с измененной функцией, которые, изменяют свойства клеток трабекулярного аппарата и как следствие отток ВГЖ. Показано, что к сходным процессам приводит появление мутантного миоцилина в почках, приводя к мезангиопролиферативному гломерулонефриту (Goldwich A ., 2005)

нормальный правильный миоцилин дикий тип

мутированный миоцилин цитотоксичность

Рис. 4. Цитотоксичность мутированного миоцилина.

На верхнем рисунке показаны клетки трабекулярного аппарата в норме. На нижнем рисунке показаны те же клетки после действия на них в течение 24 часов

На рис. 4 вверху показаны клетки трабекулярного аппарата в норме, внизу показаны те же клетки после действия на них в течение 24 часов укороченного миоцилина при замене аминокислоты пролин на лейцин в 370-й позиции (Yuan He , 2009). Авторы статьи, таким образом, показывают наличие цитотоксичности мутированного миоцилина.

Наша задача – выяснить, есть ли полиморфизмы и делеции/дупликации в гене миоцилина у пациента, или нет. И если есть, что в этом случае делать? Для начала рассмотрим, какие мутации в гене миоцилина уже известны.

4. Описанные мутации в гене миоцилина

  • частота мутаций
  • особенности российской популяции
  • серьезность последствий различных мутаций

Показано, что мутации в гене миоцилина приводят к развитию врожденной и ювенильной глаукомы и встречаются в 2 – 10% случаев у пациентов с первичной открытоугольной глаукомой. Единичные исследования, проводимые в России ( Астахов Ю.С., Васильев В.Б., Рахманов В.В., 2005, Бикбов М.М., Суркова В.К. и др. 2010), не дают достаточно материала для оценки особенностей в вариациях гена в Российской популяции. Необходимо создание референсной базы населения России для выявления патогенных и нейтральных полиморфизмов.

Основную долю описанных в мировой базе мутаций миоцилина составляют миссенс (83%) и нонсенс (6,4%) мутации. Малые (меньше 21 пары нуклеотидов) делеции, вставки и комбинация вставка/делеция составляют соответственно 4,3%, 5,3% и 1,1%. (Рис. 5)

основные мутации в миоцилине

Рис. 5. Спектр мутаций, описанных в гене миоцилина (MYOC)

Несколько сотен полиморфизмов, описанных для миоцилина, собраны в базе данных: myocilin.com/variants.php. Так как данная статья посвящена поиску изменений в геноме, приводящих к глаукоме, считаю уместным в качестве примера привести здесь полную таблицу (табл. 2) мутаций миоцилина, ведущих к глаукоме (95 шт), нейтральных полиморфизмов (146) и замен с недоказанной патогенностью (18):

Таблица 2. Полиморфизмы, описанные в гене миоцилина

Положение

Замена аминокислоты

Нуклеотидная замена

Вызывает ли глаукому

Промотер

-2084g>t

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-1770g>a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-1760ins_a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-1422g>t

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-1378ins_t

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-1340del_a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-1333g>a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-1081a>g

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-1000c>g

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-700_-699ins

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-467gt>ca

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-387c>t

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-339gt11-19

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-320c>t

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-315g>a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-306g>a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-306g>t

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-255t>c

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-241g>a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-224t>c

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-190g>t

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-159t>c

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-153t>c

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-127t>c

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-126t>g

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-126t>c

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-92_-91del_ct

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-83g>a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-78t>g

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-77g>a

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-18c>t

Нейтральный полиморфизм

Промотер

-8c>t

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Phe4Ser

11T>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Cys8X

24C>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Cys9Ser

26G>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gly12Arg

34G>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Pro13Leu

38C>T

Патогенность не доказана

Экзон 1

Pro13Pro

39T>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Pro16Leu

47C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Ala17Ser

49G>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Val18Leu

52G>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Cys25SerfsX65

56_72dup

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Gln19His

57G>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Cys25Arg

73T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Arg33Lys

98G>A

Патогенность не доказана

Экзон 1

Arg46X

136C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gln48His

144G>T

Патогенность не доказана

Экзон 1

Val53Ala

158T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Ser55Thr

164G>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Asn57Asp

169A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Ser69Ser

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Val70Val

210C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Asn73Ser

218A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Arg76Lys

227G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Asp77Glu

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Arg82Cys

244C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Arg82His

245G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Thr88Thr

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Arg91X

271C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Leu95Pro

284T>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Glu96Glu

288G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gln101Gln

303A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Thr103Thr

309C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Ala108Gly

323C>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gln118Leu

353A>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gly122Gly

366C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gly122Gly

366C>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Thr123Thr

369C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Leu124Leu

372G>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Arg125SerfsX158

375delG

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Arg126Trp

376C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Arg126Gln

377G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Arg128Arg

384G>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gln134Gln

402A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Thr135Ile

404C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Thr140Ser

419C>G

Патогенность не доказана

Экзон 1

Ala141Ala

425C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Arg158Gln

473G>A

Патогенность не доказана

Экзон 1

Leu159Leu

477A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gln161Arg

482A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Glu162dup

484_486dup

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 1

Leu166Leu

498G>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Arg168Arg

504G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Leu180Leu

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Gly183Ser

547G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 1

Arg189Gln

566G>A

Нейтральный полиморфизм

Интрон 1

604+13a>c

Нейтральный полиморфизм

Интрон 1

604+14g>a

Нейтральный полиморфизм

Интрон 1

604+16g>t

Нейтральный полиморфизм

Интрон 1

604+19g>c

Нейтральный полиморфизм

Интрон 1

604+50g>a

Нейтральный полиморфизм

Интрон 1

604+228a>t

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Ser203Phe

608C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Thr204Met

611C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Thr204Thr

612G>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Asp208Glu

624C>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Thr209Asn

626C>A

Патогенность не доказана

Экзон 2

Leu215Pro

644T>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Leu215Gln

644T>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 2

Lys216Lys

648G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Glu218Glu

654G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Arg226Gln

677G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 2

Leu228Ser

683T>C

Патогенность не доказана

Экзон 2

Glu230Lys

688G>A

Патогенность не доказана

Экзон 2

Glu240Gly

719A>G

Патогенность не доказана

Экзон 2

Thr243Thr

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Интрон 2

730+3a>g

Нейтральный полиморфизм

Интрон 2

730+35g>a

Нейтральный полиморфизм

Интрон 2

730+172c>a

Нейтральный полиморфизм

Интрон 2

731-73c>t

Нейтральный полиморфизм

Интрон 2

731-23g>a

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Gly244Ser

730G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Gly244Val

731G>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Cys245Tyr

734G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly246Arg

736G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp247X

739G>T

Патогенность не доказана

Экзон 3

Val251Ala

752T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly252Arg

754G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr256Met

767C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ala260Ala

780A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Glu261Lys

781G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Lys266Lys

798G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Arg272X

814C>T

Патогенность не доказана

Экзон 3

Arg272Gly

814C>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Arg272Arg

816A>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Asp273AspfsX344

819delC

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Pro274Arg

821C>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr285Met

854C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr285Thr

855G>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Trp286Arg

856T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ile288Ile

864C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ile288Met

864C>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Thr290Ala

868A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Thr293Lys

878C>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr293Thr

879G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Arg296Cys

886C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gln297His

893G>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Glu300Lys

898G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp302Asp

906G>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ile304Ile

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Gln309Gln

927G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ser313Phe

938C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Leu318Leu

952C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Glu323Lys

967G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr325Thr

975G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Gly326Ser

976G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Val329Met

985G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Val329Val

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ser331Thr

991T>A

Патогенность не доказана

Экзон 3

Ser331Ser

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ser331Leu

992C>T

Патогенность не доказана

Экзон 3

Ser333Cys

997A>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Leu334Pro

1001T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Phe336Phe

1008C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Gln337X

1009Cdel

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gln337Glu

1009C>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gln337Arg

1010A>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp338Asn

1014G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ser341Pro

1021T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Arg342Lys

1025G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ile345Met

1035A>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Arg346Thr

1037G>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Tyr347Tyr

1041T>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Tyr347X

1041T>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr351Thr

1053C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Glu352Lys

1054G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Thr353Ile

1058C>T

Патогенность не доказана

Экзон 3

Ille360Asn

1079T>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Pro361Ser

1081C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly362GlufsX45

1085delG

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ala363Thr

1087G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly364Val

1091G>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly367Arg

1099G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gln368SerfsX38

1100_1103delGACAinsT

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gln368X

1102C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Phe369Leu

1105T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Pro370Leu

1109C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Pro370Pro

1110G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Tyr371Asp

1111T>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly374Val

1121G>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr377Met

1130C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr377Lys

1130C>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr377Thr

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Asp380Gly

1138G>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp380His

1138G>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp380Asn

1138G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp380Ala

1139A>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp384Asn

1150G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp384Gly

1151A>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ser393Asn

1178G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ser393Arg

1179C>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr394Thr

1182C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Asp395Glu

1185T>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Glu396dup

1186_1188dup

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp395_Glu396insAspPro

1187_1188insCCCAGA

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Glu396Glu

1188G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Lys398Arg

1193A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Gly399Val

1196G>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly399Asp

1196G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Val402Ile

1204G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Leu403Leu

1209C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Leu413Leu

1239C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Glu414Lys

1240G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Arg422Cys

1264C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Arg422His

1265G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Lys423Glu

1267A>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ser425Pro

1273T>C

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ser425X

1274C>G

Патогенность не доказана

Экзон 3

Val426Phe

1276G>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Val426Val

1278C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ala427Thr

1279G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asn428Ser

1283A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Phe430Leu

1288T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Cys433Arg

1297T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly434Ser

1300G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly434Gly

1303C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Tyr437His

1309T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr438Ile

1313C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Thr438Thr

Не определено

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Val439Val

1317C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Val439Val

1317C>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ala445Val

1334C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asp446Tyr

1336G>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ala447Val

1340C>T

Патогенность не доказана

Экзон 3

Thr448Pro

1342A>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asn450Asp

1348A>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Arg450Tyr

1348A>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Tyr453MetfsX11

1357delT

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Thr455Lys

1364C>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Gly458Asp

1373G>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ile465Met

1395C>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Arg470Cys

1408C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Arg470His

1409G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Tyr471Cys

1412A>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Tyr473Cys

1418A>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Met476Arg

1427T>G

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ile477Asn

1430T>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ile477Ser

1430T>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Tyr479His

1435T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asn480Lys

1440C>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Asn480Lys

1440C>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Pro481Thr

1441C>A

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Pro481Ser

1441C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Pro481Arg

1442C>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Pro481Leu

1442C>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Glu483X

1447G>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ala488Ala

1464C>T

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Val495Ile

1483G>A

Нейтральный полиморфизм

Экзон 3

Ile499Phe

1495A>T

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Ile499Ser

1496T>G

Мутация, приводящая к глаукоме

Экзон 3

Lys500Arg

1499A>G

Патогенность не доказана

Экзон 3

Ser502Pro

1504T>C

Мутация, приводящая к глаукоме

 

*4g>c

Нейтральный полиморфизм

 

*20a>g

Нейтральный полиморфизм

 

*73g>c

Нейтральный полиморфизм

 

*291a>g

Нейтральный полиморфизм

 

1544ins489X

1544insC

Мутация, приводящая к глаукоме

 

1q24.3_1q31.2del

Патогенность не доказана

 

1q23_1q25del

Нейтральный полиморфизм

Мутациями в гене миоцилина, приводящими к самой тяжелой клинической картине, являются те, которые приводят к обрыву цепи (всего их описано четыре: rs139804296, rs74315329, rs143413116, rs74315337 в положениях 171605329, 171605478, 171621481 и 171621616 соответственно), а также 46 миссенс вариантов – ведущих к изменению структуры считываемого белка (список их можно легко найти в базе данных ensembl.org, подробнее на странице www .oftalmic.ru/pubmed-gene-manual.php)

5. Подходы к лечению генетических аномалий в гене MYOC

Мы добрались до самого интересного и самого главного. Как, используя новый инструмент, генетическую диагностику, подходить к индивидуальному, эффективному, направленному на устранение причины глаукомы лечению наших пациентов?

В последние годы в англоязычной литературе появился целый шквал публикаций о новых попытках и подходах к молекулярно-генетическим способам лечения болезней, часто совмещая достижения в технологии, молекулярной биологии и генетике. Что касается конкретного вопроса лечения миоцилиновой глаукомы (с позволения, назовем ее так), то действенных методов пока не так много. Проводятся единичные клинические испытания в США, оценивающие эффективность блокировки гена миоцилина короткоцепочечными РНК.

Разберем общую суть предлагаемого лечения, хотя, конечно же, в данной публикации множество деталей будет упущено из виду, однако они будут рассмотрены в дальнейших публикациях. Мне очень импонирует изящность предлагаемого способа лечения.

В виде глазных капель (!) подбирают короткоцепочечные фрагменты РНК, (в англоязычной литературе short interfering – siRNA), последовательность их известна, представлена ниже на рис.5. Должным образом упакованные (в липосомы или полиамидоаминовые дендримеры – наночастицы для целевой доставки действующего вещества к нужным клеткам, подробнее о них здесь: www .oftalmic.ru/b_retinoblastoma.php) их закапывают в глаза.

Таблица 3. короткоцепочечные РНК, применяемые для генетического лечения миоцилиновой глаукомы

Контроль

5'-aacagtcgcgtttgcgactgg- 3'

siMYOC-A

5'-aacttacagagagagacagcagc- 3'

siMYOC-B

5'-aataccgagacagtgaaggct- 3'

siMYOC-C

5'-aacatccgtaagcagtcagtc- 3'

siMYOC-D

5'-aaccccctggagaagaagctc- 3'

В клетках трабекулярного аппарата и сетчатки эти siРНК комплиментарно связываются с участками гена миоцилина (так как они специальным образом подобраны именно под этот ген), не давая производить мРНК и останавливая синтез мутированного гена миоцилина. Данный способ описан в американском патенте US7700575. Далее возможны варианты. Либо на этом останавливаются, так как терапевтический эффект достигнут – при таком подходе блокируется синтез не всего, но значительной части измененного миоцилина, так что при гаплонедостаточности (когда поврежден только один аллель миоцилина, второй функционирует нормально) этот метод эффективен, прогрессирование глаукомы практически останавливается. Либо вторым этапом можно внедрять вектор со здоровым геном миоцилина, данный подход будет иметь смысл при гомозиготном состоянии, когда оба аллеля миоцилина повреждены. Данный вопрос – тема дальнейших публикаций, а пока, согласитесь, изящный метод?

По аналогичной схеме, только более кратко, будут рассмотрены мутации в гене CYP1B1 и OPTN .

Ген CYP1B1 (цитохром P450)

1. Характеристика гена

Ген цитохрома расположен на коротком плече 2-й хромосомы в локусе 2p22.2, длиной 8,58 кб, имеет 3 экзона, впервые был описан в начале 1990-х в группе профессора Burke , секвенирован и опубликован под данным названием в 2001 году группой исследователей проекта «Геном человека» Nature 409 (6822), 860-921 (2001) PMID 11237011. Кодирует 1 из 57 мембран-связанных ферментов гем-тиолатных (обычно от цистеинового остатка) монооксигеназ семейства цитохромов P450 подсемейства B полипептид 1, участвующих во многих каталитических реакциях, в том числе в синтезе холестерина, стероидов и других липидов, витамина D , а также в метаболизме лекарств.

ген CYP1B1 с тремя экзонами

Рис. 6. Три экзона гена цитохрома CYP1B1

2. Функция белка, синтезируемого с гена CYP1B1 в норме и при мутациях

Фермент, кодируемый этим геном, располагается в эндоплазматическом ретикулуме и Фермент, кодируемый этим геном, располагается в эндоплазматическом ретикулуме и метаболизирует проонкогены, такие как полицикличные ароматические углеводороды и 17-бета эстрадиол. В микросомах печени этот фермент вовлечен в НАДФН-зависимый путь переноса электрона.

3. Какую роль играет CYP1B1 в развитии глаукомы

Предполагается, что этот фермент метаболизирует также сигнальную молекулу, вовлеченную в развитие глаза, возможно, стероид, поэтому мутации в гене цитохрома приводят к различным аномалиям строения глаза, в том числе приводящим к глаукоме. То есть данный фермент разлагает молекулу, которая принимает активное участие в правильном формировании угла передней камеры глаза и его фильтрующих структур. Существуют карты метаболизма CYP1B1 эстрадиола, ретинола и бензпирена (например, от компании GeneGo).

4. Описанные мутации в гене CYP1B1

  • частота мутаций
  • особенности российской популяции
  • серьезность последствий различных мутаций

Показано, что от 20 до 50% пациентов с ПОУГ имеют мутации в гене цитохрома P450. Всего описано 4499 вариаций в экзонах и интронах гена CYP1B1, в том числе 16 – обрыв цепи, 36 – сдвиг рамки считывания, 6 вставок в пределах рамки и 134 миссенс варианта. Референсной базы вариаций гена на Российской популяции пока не создано. Общемировая база вариаций гена доступна в GenBank и ensembl.org. В таблице 4 приведены основные аномалии, к которым приводят мутации в гене CYP1B1 и ссылки на статьи.

Таблица 4. Список аномалий, к которым приводят мутации в гене CYP1B1

Заболевание

Код статьи в базе PubMed

Врожденная глаукома

9097971 (4), 18852424 (4), 15475877 (3), 19536304 (3)

Аномалия Петерса

16735991 (3), 15682044 (3), 20151268 (1), 16638984 (1)

Рак молочной железы

20093341 (6), 15734954 (6), 9823305 (5), 20037207 (5)

Глаукома

11774072 (4), 19622003 (3), 15342693 (2), 19668563 (2)

Синдром Ригера

16735994 (2), 17106362 (1)

ПОУГ

16862072 (1), 19096718 (1), 20198978 (1), 17361544 (1)

Открытоугольная глаукома

16319821 (2), 19793111 (2), 17563717 (2), 15342693 (1)

Опухоль эндометрия

14656940 (6), 12873984 (6), 15285606 (3), 20492382 (3)

Химический онкогенез

12520071 (1)

5. Подходы к лечению генетических аномалий в гене CYP1B1

Подходы к лечению генетических аномалий в гене CYP1B1 немногочисленны. Предлагается перенос определенным образом запрограммированных стволовых клеток с «диким типом» гена CYP1B1 у пациентов с мутациями с гене CYP1B1 (Choudhary D 2009).

Ген OPTN (оптиневрин)

1. Характеристика гена

Ген оптиневрин OPTN расположен на коротком плече 10-й хромосомы в локусе 10p13, длиной 38,2 кб и имеет 16 экзонов. С данного гена синтезируется спирализованная спираль, белок оптиневрин, который играет важную роль в поддержке комплекса Гольджи, экзоцитозе, перемещении мембран посредством взаимодействия с миозином VI , Rab 8 и хангтингтином. Оптиневрин экспрессируется в трабекулярном аппарате, цилиарном теле, сетчатке, мозге, коре надпочечников, в лимфоцитах, фибробластах, скелетных мышцах, сердце, печени, в плаценте и у плода.

ген оптиневрин optineurin 16 экзонов

Рис. 7. Ген оптиневрин OPTN и его 16 экзонов

С гена оптиневрина считываются 12 различных белков (варианты сплайсинга). При мутациях в гене оптиневрина описаны следующие глазные состояния: первичная открытоугольная глаукома, атрофия зрительных нервов, слепота, офтальмогипертензия, глаукома нормального давления, а также мутации в гене оптиневрина приводят к боковому амиотрофическому склерозу.

2. Функция белка, синтезируемого с гена OPTN в норме и при мутациях

Оптиневрин подавляет индукцию интерферона бета в ответ на инфекцию РНК вирусом. Играет нейропротекторную роль в глазу и зрительном нерве. Возможно, является частью сигнального пути, который сдвигает равновесие в сторону индукции клеточной смерти. Может являться клеточной мишенью для аденовируса Е3 14.7, ингибитора функции TNF -альфа, влияя, таким образом, на клеточную смерть. Взаимодействует с фактором транскрипции IIIA (GTF3A). Взаимодействует с TRAF3, TBK1 и MYO6. Связывается с убиквитином. Следует обратить внимание, что в клетке оптиневрин располагается в основном вокруг ядра и связан с комплексом Гольджи, а также в везикулах рядом с клеточной мембраной.

3. Какую роль играет оптиневрин в развитии глаукомы

При нарушении функции белка оптиневрина из-за мутации в нем координация внутриклеточных структур, связанных с комплексом Гольджи и транспорт в клетке изменяются, что приводит замедлению метаболизма и гибели нервных клеток зрительной системы, давая картину глаукоматозного изменения зрительного нерва в отсутствии повышенного внутриглазного давления.

4. Описанные мутации

  • частота мутаций
  • особенности российской популяции
  • серьезность последствий различных мутаций

Наиболее четкая взаимосвязь между мутацией и развитием нормотензивной глаукомы прослеживается в случае замены глутамина на лизин в 50-м положении (Glu50Lys) rs28939688 из-за замены гуанина на аденин в 458 позиции (458G>A) (Tin Aung, 2005). Также довольно стабильно при мутациях, приводящих к заменам His26Asp, Glu104Asp, Thr202Arg, Ala336Gly, Ala377Thr, His486Arg, Arg545Gln, и c.691-692insAG развивается глаукома.

Что касается остальных полиморфизмов в гене миоцилина, то их достаточно много, они разнообразны и четкой взаимосвязи между мутацией и развитием глаукомной оптической нейропатии выявить пока не удается. В нашей лаборатории мы проводим анализ на наличие замены глутамина на лизин в 50-м положении ( Glu 50 Lys ) rs28939688 путем секвенирования данного участка ДНК.

5. Подходы к лечению генетических аномалий в гене OPTN

Публикаций, подробно рассматривающих подходы к замене мутированного гена CYP1B1 на нормальный или блокировку гена с патологической функцией, я пока не нашла. Однако, на мой взгляд, общие принципы генной терапии в данном случае такие же, как и при коррекции функции других генов, Уже открывается новая эра, новая волна исследований и публикаций об особенностях и последствиях вмешательства в экспрессию генов, приводящих к развитию глаукомы. Дойдет очередь и до оптиневрина, а пока следует лучше разобраться с его функциями, полиморфизмами и клиническими признаками генетических вариаций.

В табл. 5 рассмотрены параметры генов, описанных в статье.

Таблица 5. Длина рассмотренных в статье генов и количество экзонов в них

 
Размер гена, кб
Количество экзонов
Длина экзонов (с какого по какой нуклеотид)
MYOC
17,22
3
1..626,13912..14037,15925..17217
CYP1B1
8,58
3
1..401,792..1835,4871..8578
OPTN
38,20
16
1..221,8057..8208,8881..8934,9016..9207,
10193..10395,12372..12554,16186..16259,
18807..18959,22304..22406,23914..24029,
25337..25486,25865..25958,27664..27822,
31986..32116,33421..33500,36664..38195

Диагнозы, при которых показан поиск мутаций в генах MYOC, OPTN и CYP1B1

  • MYOC – MIM 601652 ПОУГ ювенильная
  • CYP1B1 – MIM 601771 ПОУГ ювенильная
  • OPTN – MIM137760 нормотензивная глаукома, атрофия зрительных нервов

Зачем делать генетический анализ на наличие мутаций в генах?

Во-первых, чтобы лечить заболевание наиболее эффективно, нужно его сначала диагностировать, как наставлял Козьма Прутков «зри в корень». Во-вторых, здесь мне хочется привести аналогию с сотовыми телефонами. Согласитесь, удобная вещь, особенно смартфон. Ведь каких-то 20 лет назад люди говорили: «Зачем нам такие дорогие телефонные аппараты, ну и что, если они без провода?» Чем больше пользователей становится у технологии, тем быстрее она развивается. Поэтому каждый проведенный генетический анализ вносит свой вклад в копилку знаний человечества о себе и приближает день, когда мы научимся справляться с глаукомой. Именно поэтому у нас такая гибкая ценовая политика проведения тестов.

Какой биоматериал необходим для проведения анализа?

Любой, содержащий ДНК исследуемого человека: кровь (венозная или капиллярная), букальный эпителий, биопсийный материал или уже непосредственная выделенная ДНК. Наиболее предпочтительным для нас материалом является венозная кровь 2,0 мл + 0,5М ЭДТА.

Как проводится генетическая диагностика:

  1. Максимально точно диагностируем болезнь по клиническим проявлениям.
  2. Собираем семейный анамнез встречаемости этой болезни и по возможности проводим данный тест у всех членов семьи с патологией.
  3. Для более полных и точных результатов генетической диагностики нужно учитывать то обстоятельство, что разные мутации могут приводить к похожим симптомам и при схожем наборе мутаций могут быть разные клинические проявления. Поэтому важно назначать правильный набор тестов, исходя из имеющихся на текущий момент знаний о мутациях, приводящих к болезни и вероятности проявления болезни.
  4. Проводим забор биоматериала и выделение ДНК
  5. Секвенируем (узнаем последовательность гена) по методу Сенгера кодирующие участки генов-мишеней
  6. Сравниваем с референсным геном/генами, отмечаем изменения в гене и степень их влияния на течение болезни
  7. Выдаем заключение с комментариями, интерпретацией результатов, заключением и рекомендациями.

Заключение:

  1. Связь мутаций в генах миоцилина (MYOC), цитохрома P450 (CYP1B1) и оптиневрина (OPTN) с развитием глаукомы доказана.
  2. Разнообразие и особенности мутаций в генах MYOC , CYP1B1 и OPTN в Российской популяции пока не описаны. Есть все основания полагать, что набор мутаций отличается от такового с США, Японии или Скандинавии, что делает актуальной разработку подходящих для России тест-систем.
  3. Разрабатываются эффективные, нацеленные на устранение причин развития глаукомы методы лечения при мутациях в генах MYOC, CYP1B1 и OPTN . Первые клинические испытания дают обнадеживающие результаты.

Список использованных ресурсов:

  1. https://sph.uth.edu/Retnet/sum-dis.htm
  2. www . ensembl . org
  3. www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank
  4. www.myocilin.com
  5. www.uniprot.org
  6. USA patent # US7700575
  7. Астахов Ю.С., Васильев В.Б., Рахманов В.В. Мутации и полиморфизмы генов миоцилина и оптиневрина: значение для ранней диагностики первичной открытоугольной глаукомы // Клиническая офтальмология. 2005. Т 6. № 2. С. 48–51.
  8. Бикбов М.М., Суркова В.К., Калентьева А.З., Хуснутдинова Э.К., Джемилева Л.У. Молекулярно-генетический анализ и его значение в диагностике первичной открытоугольной глаукомы. // Российский офтальмологический журнал, 2010, №1
  9. Aroca - Aguilar J ., S a nchez - S a nchez F ., Mart i nez - Redondo F ., Coca - Prados M ., Escribano J ., Heterozygous expression of myocilin glaucoma mutants increases secretion of the mutant forms and reduces extracellular processed myocilin Molecular Vision 2008; 14:2097-2108
  10. Baird PN, Richardson AJ, Craig JE, Mackey DA, Rochtchina E, Mitchell P. Analysis of optineurin (OPTN) gene mutations in subjects with and without glaucoma: the Blue Mountains Eye Study. Clin Experiment Ophthalmol. 2004 Oct;32(5):518-22.
  11. Choudhary D, Jansson I, Schenkman JB. CYP1B1, a developmental gene with a potential role in glaucoma therapy. Xenobiotica. 2009 Aug;39(8):606-15. PMID: 19622003
  12. Colak D, Morales J, Bosley TM, Al-Bakheet A, Alyounes B, Kaya N, Abu-Amero KK. Genome-wide expression profiling of patients with primary open angle glaucoma. Invest Ophthalmol Vis Sci. 2012 Aug 27;53(9):5899-904. Print 2012. PMID: 22871836
  13. Gibson J, Griffiths H, De Salvo G, Cole M, Jacob A, Macleod A, Yang Y, Menon G, Cree A, Ennis S, Lotery A. Genome-wide association study of primary open angle glaucoma risk and quantitative traits. Mol Vis. 2012;18:1083-92. PMID: 22605921
  14. Goldwich A, Baulmann DC, Ohlmann A, Flugel-Koch C, Schocklmann H, Tamm ER. Myocilin is expressed in the glomerulus of the kidney and induced in mesangioproliferative glomerulonephritis. Kidney Int. 2005 Jan;67(1):140-51.
  15. Fuse N. Genetic bases for glaucoma. Tohoku J Exp Med. 2010;221(1):1-10.
  16. Kumar A., Basavaraj MG, Gupta SK, et al. Role of CYP1B1, MYOC, OPTN and OPTC genes in adult-onset primary open-angle glaucoma: predominance of CYP1B1 mutations in Indian patients Mol Vis. 2007; 13: 667–676. PMCID: PMC2765475
  17. Kwon HS, Lee HS, Ji Y, Rubin JS, Tomarev SI. Myocilin is a modulator of Wnt signaling. Mol Cell Biol. 2009 Apr;29(8):2139-54.
  18. Kwon HS, Tomarev SI. Myocilin, a glaucoma-associated protein, promotes cell migration through activation of integrin-focal adhesion kinase-serine/threonine kinase signaling pathway. J Cell Physiol. 2011 Dec;226(12):3392-402.
  19. Lander ES, Linton LM, Birren B, Nusbaum C, et al. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. 2001 Feb 15;409(6822):860-921.
  20. Mookherjee S, Acharya M, Banerjee D, Bhattacharjee A, Ray K. Molecular Basis for Involvement of CYP1B1 in MYOC Upregulation and Its Potential Implication in Glaucoma Pathogenesis. PLoS One. 2012;7(9):e45077
  21. Rozsa FW, Reed DM, Scott KM, Gene expression profile of human trabecular meshwork cells in response to long-term dexamethasone exposure. Mol Vis. 2006 Feb 27;12:125-41. PMID: 16541013
  22. Xin GH, Zhao XH, Liu D, Gong Q, Hou L, Li JY, Pan BR, Li X, Cheng YJ. Effect of VEGF-targeted antisense gene therapy on retinoblastoma cell line SO-RB50 in vitro and in vivo. Int J Ophthalmol. 2012;5(4):440-7.
  23. Yuan He, Kar Wah Leung, Ye-Hong Zhuo, Jian Ge Pro370Leu mutant myocilin impairs mitochondrial functions in human trabecular meshwork cells Molecular Vision 2009; 15 :815-825.

(с) Марианна Иванова, октябрь 2012 г.

 
 
 
  Как собирать образцы для генетического анализа
Как собирать образцы для генетического анализа
 
  ДНК диагностика глазных болезней в России и СНГ
Мы работаем в России и странах СНГ
 
  Как проводится генетическая диагностика в офтальмологии
Как проводится ген.диагностика
 
  Цены на ДНК диагностику глазных болезней
Из чего складывается цена анализа?
 
  Как правильно рисовать генеалогическое дерево
Как правильно составлять историю здоровья семьи?
 
  секвенирование нового поколения
Используемые нами технологии
 
  клинические признаки при генетической диагностике
Необходимые для ген.анализа клинические данные
 
  Organum visus Голубев Сергей Юрьевич
Информационный партнер проекта
 
  Профессионально о зрении портал OD OS
Информационный партнер проекта
 
 
Copyright © Офтальмик 2008 - 2017