Офтальмик в linked in Офтальмик в твиттере Офтальмик вконтакте Статистика сайта Офтальмик.ру
Генетическая диагностика глазных болезней
.:: Новости ::: О компании ::: Услуги ::: Цены ::: Гены ::: Пациентам ::: Лечение ::: FAQ ::: Контакты ::. 
 
Диагностируем:
· Катаракта
· Глаукома
· Макулярная дегенерация
· Близорукость
· Пигментный ретинит
· Дистрофии сетчатки
· Дистрофии роговицы
· Увеиты
· Ретинобластома
· Амавроз Лебера
· Микрофтальм
· Анофтальм
· Аксенфельда-Ригера
· Ваарденбурга синдром
· Ретиношизис
· Косоглазие
· Выезд окулиста на дом
· Синдром Ашера
· Редкие болезни
 
 
Обучение
· Конференции
· Книги по офтальмогенетике
· Книга О.В. Хлебниковой Наследственная патология органа зрения
· Методы исследования в офтальмологии
· Классификация наследственных болезней сетчатки
· Критерии клинической классификации
· Форум по молекулярной медицине 2013
· Анализ геномных NGS данных
 
 
Пороки развития
· размеров и формы глаза
· придаточного аппарата
· роговицы
· сосудистой оболочки глаза
· хрусталика
· сетчатки
· зрительного нерва
· МУТАНТНЫЕ БЕЛКИ
 
 
Типы диагностики
· CLIA - что это?
· Кариотипирование
· FISH анализ
· SKY тест
· SSDGE или SSCP
· DGGE
· RFLPs
· Специфичный микрочип
· Типичный микрочип
· Прямое секвенирование
 
 
Панели тестов
· Панель "цилиопатии"
· Панель "пигментный ретинит"
· Панель "все глазные заболевания"
· Животные модели
· Пигментный ретинит: новости 2013
· Метаболизм сетчатки
· Дегенерация сетчатки и клеточная биология
 
 

Генетический ДНК анализ синдрома Ленца (микрофтальм и катаракта). Ген BCOR

OMIM номер (международная база данных наследования по законам Менделя у человека, см. словарь):

  • 206900, 610125, 611038 (Микрофтальм),
  • 606326 (SIX6),
  • 184429 (SOX2),
  • 600037 (OTX2),
  • 142993 (CHX10, VSX2),
  • 601881 (RAX),
  • 610745 (STRA6).

Описание заболевания

Частота встречаемости заболевания в популяции 1:10 000 (PMID 15971507). Приблизительно 15000 человек в России, 30000 человек в СНГ, почти 1 млн человек во всем мире имеют микрофтальм и анофтальм.

  • Анофтальмия - это полное отсутствие глазного яблока, самая серьезная форма структурной аномалии глаза, более мягкая выраженность этой аномалии - микрофтальмия, при которой длина глаза менее 21 мм (больше чем на 2 стандартных отклонения в популяции короче).
  • Придаточный аппарат глаза при этом развит правильно.
  • Сопутствующие симптомы могут проявляться как дисгенез переднего сегмента глаза, катаракта, хориоретинальная колобома, дисплазия сетчатки.
  • Анофтальм/микрофтальм является признаком многих различных генетических аномалий, у 25% пациентов удается определять вид мутации. Самыми распространенными являются аномалии генов SOX2, OTX2, VSX2, SIX6, PAX6, RAX, STRA6.
  • Внеглазные проявления включают врожденные пороки серда, когнитивные нарушения, мальформации легких, почек, лицевой дисморфизм.
Генетическая ДНК диагностика микрофтальма и анофтальма

Тип наследования (существующие типы наследования)

Гетерогенный тип наследования. SOX2, OTX2 и SIX6 - аутосомно-доминантный, VSX2, RAX и STRA6 - аутосомно-рецессивный тип наследования, некоторые мутации Х-сцепленные.

Причины проведения теста

  1. Подтверждение клинического диагноза
  2. Консультация клинического генетика, расчет вероятности заболевания
  3. Пренатальная диагностика в семьях с известной мутацией

Метод проведения теста

Для ДНК, полученной из букального эпителия или из крови в ЭДТА, проводится двунаправленное секвенирование кодирующего региона SOX2 гена (единственный большой экзон), VSX2 (экзоны с 1 по 5), OTX2 (экзоны 3 по 5) и/или STRA6 (экзоны 2 - 19). Так как STRA6 обусловленная микрофтальмия имеет аутосомно-рецессивный тип наследования, то при обнаружении мутации только в одном аллеле этого гена, проводится дополнительная сравнительная геномная гибридизация для проверки наличия дупликаций/делеций в других участках этого гена. Также при показаниях проводится поиск делеций/дупликаций в перечисленных генах: SOX2, OTX2, VSX2, SIX6 и RAX. Мутация, найденная у пациента впервые в семье, всегда перепроверяется прямым секвенированием, проводится анализ фрагментов рестрикции. Также для анализа доступна общегеномный цитогенетический олигонуклеотидный тип исследования для выявления других хромосомных аномалий.

Чувствительность теста

  • У 20 - 30 % пациентов обнаружены мутации в гене SOX2 . У пациентов с глазными и системными проявлениями синдрома Аксенфельда-Ригера частота мутаций 40%. Описано более 30 мутаций в этом гене (на 2012 год).
  • У 15 - 25% пациентов обнаружены мутации в гене STRA6
  • У 3% пациентов обнаружены мутации в OTX2
  • У 2% пациентов обнаружены мутации в VSX2

Спектр мутаций

  • OTX2 - нонсенс и сдвиг рамки считывания - самые распространенные мутации
  • SOX2 - нонсенс, сдвиг рамки считывания и полная делеция гена
  • VSX2 - в основном миссенс и делеция участка гена (в том числе полностью 3-ий экзон)
  • SIX6 - миссенс мутация c.493A>G; T165A
  • STRA6 - миссенс, нонсенс мутации, малые делеции/вставки
  • RAX - обнаружено 5 мутаций, две миссенс, две нонсенс и одна - сдвиг рамки считывания.

Требования к биологическому материалу для проведения теста

  • кровь: 2-5 мл. цельной крови в ЭДТА. Доставка за 24 часа - в прохладной упаковке при комнатной температуре. Если доставка дольше, то можно заморозить образец течение 7 дней до отправки.
  • букальный эпителий: может быть использован как альтернатива крови при секвенировании SOX2, OTX2, VSX2, STRA6 генов. Секвенирование RAX - только из венозной крови!
  • пренатальная диагностика: 10 мл амниотической жидкости, 5 мг ворсин хориона, образец материнской крови.

Сроки и цены ДНК теста

у.е.
срок
определение мутации, первичный клиент SOX2
600
ок. 5 нед.
OTX2
650
ок. 4 нед.
VSX2
770
ок. 4 нед.
RAX
770
ок. 6-8 нед.
STRA6
1980
ок. 8-9 нед.
SIX6 del/dup
500
ок. 4-6 нед.
анализ родственника на определенную известную мутацию
 
350
ок. 2 нед.
пренатальная диагностика на определенную известную мутацию
 
2000
ок. 2 нед.

Литература:

  1. Forrester and Merz (2006) Birth Defects Res A Clin Mol Terato 76:187-192.
  2. Hagstrom SA et al. (2005) Am J Med Genet (2005) 138(2):95
  3. Fantes, J et al (2003) Nature Genetics 33:462
  4. Gallardo ME et al., (1999) Genomic 61:82
  5. Gallardo, ME et al., (2004) Am J Med Genet 129A:92
  6. Bennett CP (1991) J Med Genet 1991;28:280-1
  7. Elliott J et al., (1993) 30(3):251-2
  8. Wyatt A et al., (2008) Hum Mutat. (2008) 29(11):E278-83
  9. Ragge NK et al., (2007) Eye 21(10):1290-300; Bar-Yosef U et al., (2004) Hum Genet 115: 302–309
  10. Schneider et al. (2009) Am J Med Genet 149A(12)2706-2715
  11. Bakrania et al. (2007) Br J Ophthalmol 91:1471-17476
  12. E. Ferda Percin et al., (2000) Nat Genet 25(4):397-401. Aijaz S et al (2004) Invest Ophthalmol Vis Sci. 45(11):3871-6. Ragge NK et al., (2005) Am J Hum Genet. 276(6):1008-22
  13. Williamson, KA et al. (2006) Hum Mol Genet 15(9):141

Генетический ДНК анализ причин микрофтальма. Гены микрофтальма

дополнительная информация

Тип заболевания OMIM Локус Ген Белок Тип наследования
MCOP1 251600 14q32 --- --- АР
MCOP2 610093  14q24 CHX10 гомеодоменный белок АР
MCOP3 611038  18q21.3 RAX регулятор транскрипции гомеодоменный белок АР
MCOP4 613094  8q22.1 GDF6 фактор роста дифференциации 6 ---
MCOP5 611040  11q23  MFRP мембранный белок АР
MCOP6 613517  2q37.1  PRSS56 протеаза серина 56 АР
MCOP7 613704  12p13.1 GDF3 фактор роста дифференциации 3 ---
 
 
 
  Как собирать образцы для генетического анализа
Как собирать образцы для генетического анализа
 
  ДНК диагностика глазных болезней в России и СНГ
Мы работаем в России и странах СНГ
 
  Как проводится генетическая диагностика в офтальмологии
Как проводится ген.диагностика
 
  Цены на ДНК диагностику глазных болезней
Из чего складывается цена анализа?
 
  Как правильно рисовать генеалогическое дерево
Как правильно составлять историю здоровья семьи?
 
  секвенирование нового поколения
Используемые нами технологии
 
  клинические признаки при генетической диагностике
Необходимые для ген.анализа клинические данные
 
  Organum visus Голубев Сергей Юрьевич
Информационный партнер проекта
 
  Профессионально о зрении портал OD OS
Информационный партнер проекта
 
 
Copyright © Офтальмик 2008 - 2016