Офтальмик в linked in Офтальмик в твиттере Офтальмик вконтакте Статистика сайта Офтальмик.ру
Генетическая диагностика глазных болезней
.:: Новости ::: О компании ::: Услуги ::: Цены ::: Гены ::: Пациентам ::: Лечение ::: FAQ ::: Контакты ::. 
 
Диагностируем:
· Катаракта
· Глаукома
· Макулярная дегенерация
· Близорукость
· Пигментный ретинит
· Дистрофии сетчатки
· Дистрофии роговицы
· Увеиты
· Ретинобластома
· Амавроз Лебера
· Микрофтальм
· Анофтальм
· Аксенфельда-Ригера
· Ваарденбурга синдром
· Ретиношизис
· Косоглазие
· Выезд окулиста на дом
· Синдром Ашера
· Редкие болезни
 
 
Обучение
· Конференции
· Книги по офтальмогенетике
· Книга О.В. Хлебниковой Наследственная патология органа зрения
· Методы исследования в офтальмологии
· Классификация наследственных болезней сетчатки
· Критерии клинической классификации
· Форум по молекулярной медицине 2013
· Анализ геномных NGS данных
 
 
Пороки развития
· размеров и формы глаза
· придаточного аппарата
· роговицы
· сосудистой оболочки глаза
· хрусталика
· сетчатки
· зрительного нерва
· МУТАНТНЫЕ БЕЛКИ
 
 
Типы диагностики
· CLIA - что это?
· Кариотипирование
· FISH анализ
· SKY тест
· SSDGE или SSCP
· DGGE
· RFLPs
· Специфичный микрочип
· Типичный микрочип
· Прямое секвенирование
 
 
Панели тестов
· Панель "цилиопатии"
· Панель "пигментный ретинит"
· Панель "все глазные заболевания"
· Животные модели
· Пигментный ретинит: новости 2013
· Метаболизм сетчатки
· Дегенерация сетчатки и клеточная биология
 
 

Ген PIKFYVE диагностика

вклад функции продукта гена в развитие глазной патологии

Фосфоинозитид киназа, содержащая FYVE палец. Фосфорилированные производные фосфатидилинозитола (PtdIns) регулирует функции цитоскелета, мембранный транспорт и передачу сигналов рецепторами через сборку комплексов белков на мембране клетки и эндосом. Люди имеют несколько белков PtdIns которые отличаются по степени и положению фосфорилирования кольца инозитола. Этот ген кодирует фермент (PIKfyve, также известный как фосфатидилинозитол-3-фосфат-5-киназа типа III или PIPKIII), который фосфорилирует положение D-5 в PtdIns и фосфатидилинозитол-3-фосфате (PtdIns3P), чтобы сделать PtdIns5P и PtdIns (3, 5) бифосфата. D-5 позиция также может быть фосфорилирована PtdIns4P-5-киназой(PIP5K) типа I, которые кодируются различными генами и предпочтительно фосфорилируют D-4 фосфорилированные PtdIns. В противоположность этому, PIKfyve предпочтительно фосфорилирует D-3 фосфорилированные PtdIns. В дополнение к липидкиназной активности, PIKfyve также обладает активностью протеинкиназы. PIKfyve регулирует гомеостаз эндомембраны и играет определенную роль в биогенезе эндосомных пузырьков-перевозчиков из ранних эндосом. Мутации в этом гене явлются причиной крапчатой дистрофии роговицы (CFD ), аутосомно-доминантного заболевания, характеризующегося многочисленными мелкими белыми пятнами во всех слоях стромы роговицы. Гистологически эти пятна, возможно, - это кератоциты раздутые от липидов и мукополисахаридов заполнивших интрацитоплазматические вакуоли. Альтернативный сплайсинг приводит к нескольким вариантам транскрипции, кодирующим различные изоформы.

phosphoinositide kinase, FYVE finger containing. Phosphorylated derivatives of phosphatidylinositol (PtdIns) regulate cytoskeletal functions, membrane trafficking, and receptor signaling by recruiting protein complexes to cell- and endosomal-membranes. Humans have multiple PtdIns proteins that differ by the degree and position of phosphorylation of the inositol ring. This gene encodes an enzyme (PIKfyve; also known as phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase type III or PIPKIII) that phosphorylates the D-5 position in PtdIns and phosphatidylinositol-3-phosphate (PtdIns3P) to make PtdIns5P and PtdIns(3,5)biphosphate. The D-5 position also can be phosphorylated by type I PtdIns4P-5-kinases (PIP5Ks) that are encoded by distinct genes and preferentially phosphorylate D-4 phosphorylated PtdIns. In contrast, PIKfyve preferentially phosphorylates D-3 phosphorylated PtdIns. In addition to being a lipid kinase, PIKfyve also has protein kinase activity. PIKfyve regulates endomembrane homeostasis and plays a role in the biogenesis of endosome carrier vesicles from early endosomes. Mutations in this gene cause corneal fleck dystrophy (CFD); an autosomal dominant disorder characterized by numerous small white flecks present in all layers of the corneal stroma. Histologically, these flecks appear to be keratocytes distended with lipid and mucopolysaccharide filled intracytoplasmic vacuoles. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.

Основные гены глазных заболеваний:

ABCA4
AIPL1
BCOR
BEST1
CABP4
CACNA1F
CDH23
CEP290
CERKL
CHM
CLRN1
CNGA1
CNGA3
CNGB3
CRB1
CRX
CYP1B1
DFNB31 (WHRN)
EDNRB
ELOVL4
EYS
FOXC1
FOXE3
FRMD7
FZD4
GNAT1
GPR98
GPR143
GRM6
GUCA1A
GUCY2D
HESX1
IMPDH1
LCA5
LRAT
LRP5
MYO7A
MYOC
NDP
NR2E3
NYX
OPTN
OTX2
PAX3
PAX6
PCDH15
PDE6A
PDE6B
PITX2
PRPF3
PRPF8
RAX, RB1
RDH5
RDS (PRPH2)
RHO
RLBP1
RP2
RPE65
SAG
SOX2
SOX10
STRA6
TRPM1
TSPAN12
TYR
USH1C
USH1G
USH2A
VSX2(CHX10) WDR36
XLRS1 (RS1)

Материал подготовила Полина Цепкова по заказу Марианны Ивановой
октябрь 2013

 
 
 
  Как собирать образцы для генетического анализа
Как собирать образцы для генетического анализа
 
  ДНК диагностика глазных болезней в России и СНГ
Мы работаем в России и странах СНГ
 
  Как проводится генетическая диагностика в офтальмологии
Как проводится ген.диагностика
 
  Цены на ДНК диагностику глазных болезней
Из чего складывается цена анализа?
 
  Как правильно рисовать генеалогическое дерево
Как правильно составлять историю здоровья семьи?
 
  секвенирование нового поколения
Используемые нами технологии
 
  клинические признаки при генетической диагностике
Необходимые для ген.анализа клинические данные
 
  Organum visus Голубев Сергей Юрьевич
Информационный партнер проекта
 
  Профессионально о зрении портал OD OS
Информационный партнер проекта
 
 
Copyright © Офтальмик 2008 - 2017